Diversos microrganismos e vírus causam doenças em seres humanos e outros seres vivos de importância econômica. Os professores desta linha pesquisam os mecanismos de virulência de bactérias e vírus, a fim de aportar conhecimento que auxilie na prevenção das enfermidades, como é o caso de produção de vacinas, fármacos e kits diagnóstico.